Di Kementerian Ilmu Pengetahuan, Profesor Ochanomizu bersama rekan kerjanya berusaha keras untuk mengaktifkan kembali Atom—robot pertama yang memiliki hati manusia. Atom adalah mahakarya Profesor Umatarou Tenma yang penuh teka-teki, yang membuat android untuk menggantikan mendiang putranya, Tobio. Namun, saat Tenma menutup gagasannya dan menghilang, Ochanomizu menolak membiarkan terobosan besar dalam sains menjadi sia-sia.
Meski berpenampilan seperti anak berusia sembilan tahun, Atom tidak hanya memiliki kekuatan dan kecerdasan yang luar biasa, namun ia juga diberkahi dengan hati nurani dan kasih sayang yang luar biasa yang menyaingi manusia. Sayangnya, anak mekanik itu segera menghadapi penolakan dan mengetahui bahwa tidak semua orang ramah seperti Ochanomizu. Meskipun robot telah berintegrasi ke dalam masyarakat, mereka hanya diterima sebagai alat dan bahkan dipandang sebagai ancaman yang akan datang terhadap kekuasaan umat manusia.
Memimpikan dunia di mana manusia dan robot bisa sejahtera bersama, Atom mendedikasikan keberadaannya untuk melindungi kehidupan keduanya dan menginspirasi mereka untuk membentuk ikatan yang tulus.
Credit: Penayangan-Fansub