Pada suatu sore yang hujan, Detektif Boys menyaksikan pembunuhan di seberang jalan. Dihalangi oleh lalu lintas, pelakunya menyelinap pergi dan Conan Edogawa ditinggalkan satu petunjuk oleh seorang detektif sekarat. Beberapa hari kemudian, detektif lain ditemukan terbunuh di tempat parkir, membuat polisi bingung. Curiga bahwa pelakunya adalah salah satu dari mereka, semua orang di departemen kepolisian tanpa alibi menjadi tersangka. Tapi meskipun waspada, mereka kalah manuver dan menderita serangan lagi — kali ini dengan Ran Mouri menemukan dirinya dalam baku tembak.
Trauma, Ran terbangun di rumah sakit dengan amnesia retrograde, mengingat apa-apa tentang hidupnya. Segera dibebaskan, dia berjuang untuk mengingat masa lalunya dan menjadi takut tidak mendapatkan kembali ingatannya sebelum menjadi sasaran pembunuh atas apa yang dia saksikan. Saat dia dijaga oleh teman dan keluarga, terserah Conan untuk mengumpulkan petunjuk dan menemukan siapa pembunuhnya sebelum mereka menyerang lagi.
