Conan Edogawa, Boys Detektif, dan Profesor Hiroshi Agasa memutuskan untuk mengunjungi Menara Kembar Nishitamashi. Di sana mereka bertemu dengan Ran Mouri; teman terdekatnya, Sonoko Suzuki, dan ayah Ran, Kogorou Mouri yang terkenal. Mempelajari ketiganya menghadiri pembukaan menara, Conan dan perusahaan ikut serta untuk tur pribadi ke lantainya.
Namun, saat persiapan untuk upacara pembukaan telah diselesaikan, kunjungan mereka tiba-tiba berubah—tiga pembunuhan brutal terjadi, yang tampaknya terkait dengan Porsche 356A yang misterius. Segera setelah itu, saat Conan dan para detektif menyelidiki kasus ini lebih dalam, menara diguncang oleh ledakan. Dengan api yang menyebar dengan cepat dan nyawa dalam bahaya, polisi mati-matian berusaha mengevakuasi semua orang. Tapi ketika lift, satu-satunya cara mereka untuk melarikan diri turun, Conan dan teman-temannya tertinggal. Dengan bantuan dalam perjalanannya, mereka dengan panik berusaha menjaga keamanan semua orang, tetapi waktu hampir habis jika mereka ingin membawa pelaku ke pengadilan.
