Di Touto Stadium, pertandingan sepak bola J. League sedang berlangsung. Selama ini, Detektif Kogorou Mouri menerima ancaman bom dari penelepon tak dikenal dan teka-teki misterius yang menunjukkan lokasinya. Conan Edogawa sekarang harus menyelamatkan para penggemar permainan sebelum waktu habis.
Untungnya, dengan tindakan cepat Conan dan pemikiran cerdas, bom tersebut ditemukan dan ledakan dapat dihindari. Pelakunya tidak berhenti sampai di situ; Detektif Kogorou diberi tahu tentang bom tersembunyi lainnya yang akan meledak di sebuah acara besar di kota. Terpaksa berpacu dengan waktu, dengan ribuan nyawa yang dipertaruhkan, Conan harus memecahkan teka-teki lain, menemukan tempat bom, dan menangkap pelakunya untuk melarikan diri dari tragedi yang mengerikan.