Setelah absen satu tahun, Shinpachi Shimura kembali ke Edo, hanya untuk menemukan kejutan yang mengejutkan: Gintoki dan Kagura, sesama anggota Yorozuya, telah menjadi karakter yang sama sekali berbeda! Melarikan diri dari markas Yorozuya dalam kebingungan, Shinpachi menemukan bahwa semua penghuni Edo telah mengalami perubahan yang sangat ekstrim, baik dalam penampilan maupun kepribadian. Yang paling luar biasa, saudara perempuannya Otae telah menikah dengan kepala Shinsengumi dan penguntit tak tahu malu Isao Kondou dan sedang mengandung anak pertama mereka.
Bingung, Shinpachi setuju untuk bergabung dengan Shinsengumi atas permintaan Otae dan Kondou dan menemukan transformasi yang lebih mengejutkan terjadi baik di dalam maupun di luar jajaran organisasi. Namun, mengetahui bahwa Wakil Kepala Toushirou Hijikata tetap tidak berubah, Shinpachi dan sekutu Shinsengumi yang tidak terduga berangkat untuk mengembalikan kota Edo seperti yang mereka ingat.
Dengan lebih banyak lelucon kotor, parodi lidah-di-pipi, dan referensi tak tahu malu, Gintama ‘ mengikuti tim Yorozuya melalui lebih banyak kesialan mereka di dunia Edo yang penuh semangat dan asing.
