Jepang, 1988. Sebuah ledakan yang disebabkan oleh seorang anak laki-laki dengan kekuatan psikis mengoyak kota Tokyo dan memicu pemicu yang mengarah ke Perang Dunia III. Untuk mencegah kehancuran lebih lanjut, dia ditangkap dan ditahan, tidak pernah terdengar lagi. Sekarang, di tahun 2019, versi kota yang direstorasi yang dikenal sebagai Neo-Tokyo—daerah yang penuh dengan kekerasan geng dan terorisme terhadap pemerintah saat ini—berdiri menggantikannya. Di sini, Shoutarou Kaneda memimpin “Kapsul”, sekelompok orang aneh yang dikenal suka mengendarai sepeda motor kustom berukuran besar dan terus-menerus berkonflik dengan saingan mereka “Badut”.
Dalam salah satu pertempuran ini, sahabat Shoutarou, Tetsuo Shima, mengalami kecelakaan dengan seorang esper yang mendapati dirinya berada di jalan-jalan Tokyo setelah melarikan diri dari kurungan lembaga pemerintah. Melalui pertemuan ini, Tetsuo mulai mengembangkan kemampuan misteriusnya sendiri, karena pemerintah berusaha untuk mengkarantina paranormal terbaru ini dalam upaya putus asa untuk mencegahnya melepaskan kekuatan destruktif yang sekali lagi dapat membuat kota bertekuk lutut.
