Digimon Tamers terjadi di dunia di mana franchise Digimon yang populer sedang populer, terdiri dari kartun, video game, dan permainan kartu perdagangan. Takato Matsuda adalah penggemar berat Digimon yang sangat terobsesi dengan permainan kartu, dan terus-menerus melamun tentang alam semesta di dalamnya. Suatu hari, dia menemukan kartu biru misterius, yang dia geser melalui mainan pemindai untuk digunakan dalam game pertarungan populer. Mainannya tiba-tiba bersinar dan berubah menjadi Digivice, dan desain buatan penggemar Takato, Guilmon, muncul di depannya. Senang dengan prospek memiliki Digimon di kehidupan nyata, Takato merangkul pasangan barunya, dan petualangannya sebagai Digimon Tamer dimulai.
Takato dengan cepat menyadari bahwa menjadi Digimon Tamer tidak semuanya menyenangkan dan permainan—pada kenyataannya, ini jauh lebih berbahaya daripada permainan kartu yang biasa dia lakukan. Digimon Liar mulai bermunculan di seluruh Jepang, menyebabkan amukan yang mengakibatkan kekacauan dan kekacauan. Berbekal Digivice-nya, yang dapat memindai kartu perdagangan untuk memperkuat Guilmon, Takato dan rekan barunya berangkat untuk melawan Digimon nakal. Mereka ditugaskan untuk melindungi dunia dari serangan Digimon, sementara sebuah organisasi misterius bertekad untuk melenyapkan semua Digimon dan Tamer mereka yang bersembunyi di balik bayang-bayang.
