Chiyo Sakura adalah gadis sekolah menengah ceria yang jatuh cinta pada Umetarou Nozaki yang tidak sadar. Banyak kebingungan Chiyo, ketika dia mengaku pada Nozaki tercinta, dia memberinya tanda tangan yang tidak dikenalnya. Ternyata, remaja laki-laki yang tabah itu sebenarnya adalah mangaka shoujo yang disegani, diterbitkan dengan nama pena Sakiko Yumeno! Serangkaian kesalahpahaman menyebabkan Chiyo menjadi salah satu asisten manga Nozaki.
Sepanjang peristiwa lucu yang terjadi kemudian, dia berteman dengan banyak teman sekolahnya yang unik, termasuk rekan asistennya yang tampaknya tidak tahu malu, Mikoto Mikoshiba, dan “Pangeran Sekolah”, Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun mengikuti Chiyo saat dia berusaha membantu Nozaki dengan manga-nya dan berharap dia akhirnya menyadari perasaannya.
