Berlatar tahun 2029 dan setelah Perang Dunia III dan IV, blok Asia yang dipimpin Jepang mendominasi urusan dunia. Aliansi ini mempertahankan supremasi internasionalnya melalui pasukan keamanan elitnya yang operasinya ditingkatkan secara sibernetika dalam menangani serangkaian teroris berteknologi tinggi dan ancaman lain terhadap keamanan internasional. Agen-agen tambahan ini dapat melakukan “hack hack” (yaitu, mengunduh kesadaran mereka) melalui internet yang kini ada di mana-mana ke dalam mesin lain dan antar ras manusia/mesin.
Mayor Motoko Kusanagi, seorang agen wanita yang diperkuat secara cyber, telah melacak entitas virtual yang dikenal sebagai Puppet Master dengan pasukan agen keamanannya. Dalang yang bisa berubah bentuk, sebuah ciptaan jahat dari agen saingan aparat keamanan, telah menyimpulkan bahwa mereka adalah bentuk kehidupan, “lahir di lautan informasi,” dan meminta suaka politik dan keberadaan fisik yang sebenarnya sebagai pembangkangan. dari penciptanya.
