Yuuta Takemoto, seorang mahasiswa tahun kedua di sebuah perguruan tinggi seni, berbagi apartemen murah dengan dua senior—Shinobu Morita yang eksentrik, yang terus gagal lulus karena ketidakhadirannya, dan Takumi Mayama yang bijaksana, yang bertindak sebagai senior yang tepat untuk Takemoto, sering mencari keluar untuknya.
Takemoto tidak terlalu memikirkan masa depannya sampai suatu hari di musim semi yang cerah, ketika dia bertemu dengan Hagumi Hanamoto yang menawan dan jatuh cinta pada pandangan pertama. Sangat berbakat dalam bidang seni, Hagumi mendaftar di universitas Takemoto dan segera berteman dengan mahasiswa tembikar populer Ayumi Yamada. Ayumi sudah mengenal baik ketiga teman satu flatnya dan diam-diam memendam perasaan mendalam terhadap salah satu dari mereka.
Hachimitsu to Clover adalah kisah mengharukan tentang masa muda, cinta, pencarian jiwa, dan penemuan jati diri, yang terjalin secara rumit melalui hubungan kompleks antara lima sahabat baik.