Ada makhluk kegelapan dan kejahatan yang mengganggu malam, melahap manusia yang cukup malang untuk ditangkap dalam genggaman mereka. Di sisi lain adalah Hellsing, sebuah organisasi yang didedikasikan untuk menghancurkan kekuatan supernatural yang mengancam keberadaan umat manusia. Pemimpinnya adalah Integra Fairbrook Wingates Hellsing, yang memimpin militer yang kuat dan menghabiskan hidupnya melawan mayat hidup.
Pasukan Integra yang besar, bagaimanapun, tidak ada artinya jika dibandingkan dengan senjata pamungkasnya: vampir Alucard, yang bekerja melawan jenisnya sendiri sebagai pembasmi Hellsing. Dengan pelayan vampir barunya, Seras Victoria, di sisinya, Alucard harus melawan tidak hanya monster, tetapi semua orang yang menentang Hellsing, baik mereka yang menyamar sebagai baik atau jahat.
Dalam pertempuran untuk kelangsungan hidup umat manusia, Hellsing Ultimatemembuktikan bahwa penampilan tidak seperti yang terlihat, dan terkadang senjata terhebat bisa datang dalam bentuk mimpi terburuk seseorang.