Setelah kematian orang tuanya, Yuuto Amakawa menjalani kehidupan yang biasa saja di kota. Satu-satunya masalah yang harus dia khawatirkan saat bersekolah bersama Rinko, tetangga sebelahnya, adalah alergi kucingnya. Itu semua berubah pada hari ulang tahunnya yang keenam belas, ketika seorang Ayakashi — makhluk supernatural — menyerangnya karena dosa leluhurnya. Untungnya, dia diselamatkan oleh Himari, seorang wanita kucing misterius dengan pedang, yang menjelaskan bahwa Yuuto adalah keturunan dari keluarga pembunuh iblis, dan dia ada di sana untuk melindunginya sekarang karena pesona yang membuatnya tersembunyi dari hal-hal gaib. kekuatan dunia telah kehilangan kekuatannya.
Omamori Himarikronik urusan Yuuto dengan berbagai kekuatan dunia supernatural, serta semakin banyak wanita yang muncul di depan pintunya, masing-masing dengan keinginan gelap mereka sendiri. Akankah Yuuto dapat menyesuaikan diri dengan lingkungan barunya yang “menarik”? Atau akankah hantu masa lalunya (leluhur) menyusulnya?