Perbukitan Pulau Koumi yang indah adalah salah satu dari banyak alasan wisatawan mengunjungi pantainya alasan yang menempati urutan kedua setelah terumbu karangnya yang indah dan legenda Anne Bonnie dan Mary Read. Museum yang menampung pedang dan pistol dari duo bajak laut pemberani ini sangat mengagumkan bagi pariwisata pulau kecil itu.
Dalam perjalanan ke pulau itu, Kogorou Mouri yang terkenal bergabung dengan putrinya Ran, sahabatnya Sonoko Suzuki, Detektif Boys, dan Conan Edogawa. Setelah kebingungan di hotel mengenai kamar mereka, kelompok itu bertemu dengan pemburu harta karun dan berkenalan dengan demam harta karun pulau itu. Dikirim untuk berburu sendiri, Detektif Boys menjelajahi pulau; sementara di perairan yang jauh lebih keras, Conan menemukan pembunuhan. Polisi, mengikuti petunjuk dari perampokan baru-baru ini, tiba segera setelah itu, dan Koumi jatuh ke dalam kekacauan.
Berikut ini adalah aksi gila tidak hanya oleh para pemburu harta karun tetapi juga penduduk Koumi untuk mengamankan barang rampasan Anne dan Mary yang telah lama hilang. Namun, sementara itu, Conan, Kogorou, dan polisi mencari satu hal yang jauh lebih besar daripada kekayaan keadilan.