Dilempar ke sel isolasi setelah upaya penyelamatan yang berani, Jolyne Kuujou berjuang untuk mengungkap rencana jahat Whitesnake, Stand musuh yang pengguna misteriusnya tetap tidak diketahui olehnya.
Pengguna Whitesnake sebenarnya adalah Enrico Pucci, pendeta dan pendeta dari Penjara Green Dolphin Street. Pucci berbagi hubungan yang mendalam dengan penjahat yang pernah menjangkiti garis keturunan Joestar, membuat perseteruannya dengan Jolyne dan ayahnya, Joutarou, menjadi perseteruan pribadi. Berniat untuk melaksanakan rencana induk mendiang temannya, Pucci menggunakan penjara dan narapidana untuk memenuhi rencana jahatnya.
Dibantu oleh sesama tahanan, seperti Ermes Costello dan Foo Fighters, Jolyne melawan beberapa pengguna Stand musuh. Saat konsekuensi dari plot Pucci menyebar ke luar batas penjara dan mulai mengancam seluruh dunia, Jolyne merangkul garis keturunan keluarganya dan mempertaruhkan nyawanya untuk mengakhiri kejahatan.
