Selama tiga tahun terakhir, Sekolah Menengah Teikou telah mendominasi kancah bola basket nasional dengan barisan legendarisnya: “Generasi Keajaiban”. Itu terdiri dari lima keajaiban yang unggul dalam olahraga, tetapi “Phantom Sixth Man” mengintai di bayang-bayang dan membantu tim mendapatkan status terhormat mereka. Akhirnya, pertumbuhan mereka yang luar biasa membuat mereka lelah dari olahraga yang mereka sukai dan membuat mereka berpisah di sekolah menengah.
Untuk mencari anggota baru, tim bola basket SMA Seirin merekrut Taiga Kagami dan Tetsuya Kuroko, dua siswa baru yang tampaknya memiliki perbedaan kemampuan yang signifikan. Setelah kembali baru-baru ini dari Amerika, Kagami memiliki bakat alami dan kecintaan yang tiada henti pada olahraga tersebut. Sementara itu, Kuroko tidak memiliki kehadiran dan tidak menunjukkan bakat atletik yang luar biasa. Namun, kemudian terungkap bahwa dia adalah Phantom Sixth Man Teikou — pemain yang pernah menjadi bagian dari Generasi Keajaiban.
Kuroko ingin membuktikan kepada tim Seirin bahwa dia kuat dengan caranya sendiri. Melihat keyakinannya, Kagami membentuk kemitraan yang dinamis dengan Kuroko, yang terakhir berjanji untuk mendukung “cahaya” Kagami sebagai “bayangannya”. Bersama rekan setim baru mereka di Seirin, mereka bertujuan untuk menaklukkan kejuaraan Interhigh yang akan datang, tetapi kemunculan kembali mantan rekan setim Kuroko memperumit rencana mereka.
