Pada suatu hari musim panas yang hangat, seorang anak laki-laki mendengar suara lonceng berdentang, seolah sedang merayakan, di gunung dekat rumahnya. Beberapa tahun kemudian di gunung yang sama, mushishi Ginko bertemu dengan seorang gadis aneh dengan rumput liar yang tumbuh di tubuhnya. Segera setelah itu, Ginko secara kebetulan bertemu dengan bocah laki-laki dewasa Yoshiro dalam perjalanan turun gunung. Dengan bantuan Yoshiro, Ginko segera mulai mengungkap siapa gadis misterius ini dan apa yang terjadi padanya.
Adaptasi dari arc terakhir di manga, Mushishi Zoku Shou: Suzu no Shizuku mengikuti perjalanan aneh Ginko di tengah-tengah okultisme untuk mengungkap misteri di balik gadis misterius bernama Kaya dan gunung yang telah menjadi rumahnya.
